Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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