Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXO1Q12778 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXO1Q12778 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXO1Q12778 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXO1Q12778 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXO1Q12778 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXO1Q12778 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXO1Q12778 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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