Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAAP100Q0VG06 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms