Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms