Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms