Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms