Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF2Q01130 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms