Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms