Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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