Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H3F3AP84243 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H3F3AP84243 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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