Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX1P78337 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX1P78337 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX1P78337 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms