Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms