Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms