Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms