Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJC1P36383 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJC1P36383 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJC1P36383 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms