Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms