Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms