Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 472.6 ms