Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL1P33121 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms