Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFNP31947 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFNP31947 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFNP31947 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms