Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTKP29376 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTKP29376 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTKP29376 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTKP29376 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms