Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PLNP26678 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms