Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRCP23327 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HRCP23327 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRCP23327 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms