Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCMT1P22061 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCMT1P22061 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms