Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD247P20963 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD247P20963 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD247P20963 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms