Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms