Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms