Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BMP3P12645 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BMP3P12645 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms