Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms