Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms