Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms