Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHGAP10645 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHGAP10645 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHGAP10645 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHGAP10645 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHGAP10645 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHGAP10645 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms