Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms