Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms