Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DENRO43583 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DENRO43583 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms