Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF13O43567 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF13O43567 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF13O43567 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF13O43567 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF13O43567 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF13O43567 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF13O43567 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms