Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms