Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNMO15061 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms