Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNJ2O15056 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms