Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms