Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms