Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISM1B1AKI9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms