Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED16Q9Y2X0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms