Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms