Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms