Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD3Q9UJU5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD3Q9UJU5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD3Q9UJU5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD3Q9UJU5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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