Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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