Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms