Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms