Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms